Op 23-jarige leeftijd, in 1825, besloot Victor priester te worden. Waarom het tot 1830 duurde vooraleer hij in het seminarie trad, is onduidelijk. Hield Nimal het bij vaderlijk verzet tegen de roeping van zijn zoon, dan beklemtoont Debroey familiale omstandigheden en vooral de politieke situatie - de Belgische seminaries bleven onder het Hollandse Bewind een tijdlang gesloten - als reden.

De sluiting van de seminaries werd door de Nederlandse overheid opgeheven in 1829. Victor Scheppers behoorde tot de eerste groep van seminaristen die na de Belgische onafhankelijkheid tot priester werden gewijd, meer bepaald op 13 april 1832. Hij was de eerste wijdeling van de pas aangestelde aartsbisschop Engelbert Sterckx.